Boldenon může být přeměněn na estrogen, ale méně než testosteron, navíc je boldenon metabolizován na 1,4-diendion, který je silným inhibitorem aromatázy.Boldenon je konvertován 5-alfa reduktázou na 1-testosteron, silnější steroid, a také na 5-beta izomer, který je považován za neaktivní metabolit.Vazba na SHBG je u boldenonu mnohem nižší než u testosteronu, což znamená vyšší volnou koncentraci v plazmě, ale kratší poločas v plazmě.Existuje malá nebo žádná vazba na progesteronové nebo glukokortikoidní receptory a žádné skutečné údaje o interakci boldenonu s různými enzymovými systémy.

Boldenon působí podobně jako metandrostenolon s méně nežádoucími androgenními účinky.Má velmi dlouhý poločas rozpadu a může se ukázat na steroidním testu po dobu až 5 měsíců, kvůli dlouhému undecylenátovému esteru připojenému k mateřskému steroidu.Stopová množství léku lze snadno detekovat měsíce po přerušení užívání.
Ačkoli je boldenon běžně srovnáván s nandrolonem, postrádá interakci s progesteronovým receptorem a všechny související progestogenní vedlejší účinky.